Protokol programu unison není zpětně kompatibilní. Pro podržení balíčku v púvodní verzi 2.13 dejte do souboru /etc/apt/preferences:
Package: unison Pin: version 2.13* Pin-Priority: 1001 Package: unison-gtk Pin: version 2.13* Pin-Priority: 1001
Verzi 2.13 je možné instalovat i paralelně ze samostatněho baliku (zkoušeno na Karmic,lucid) z adresy http://packages.ubuntu.com/intrepid/i386/unison2.13.16-gtk/download